Kliiniku põhitegevus on ambulatoorse ja statsionaarse kirurgilise arstiabi osutamine üldkirurgia, onkoloogilise günekoloogia, veresoontekirurgia, uroloogia, lastekirurgia, plastikakirurgia ja organtransplantatsiooni erialal.
Kirurgiakliinik on ainus keskus Eestis, kus toimub neerude, maksa ja pankrease siirdamine.